Sekwenator NovaSeq 6000

Sekwenator NovaSeq 6000

System NovaSeq – nowa era w sekwencjonowaniu następnej generacji

Sekwenator NovaSeq 5000-6000

Opis

System do sekwencjonowania NovaSeq firmy Illumina to urządzenie do sekwencjonowania  w szerokim zakresie zastosowań. System NovaSeq 6000 zapewnia aplikacje z jeszcze wyższą wydajnością przy najniższych kosztach na próbkę. Seria NovaSeq zapewnia olbrzymią skalowalność i elastyczność, aby dostosować się do różnorodnych zastosowań i rozmiarów projektów przy jednoczesnym osiągnięciu maksymalnej wydajności. System wykorzystuje technologię sekwencjonowania przez syntezę (sequencing by synthesis – SBS) oraz technologię uporządkowanego wzoru flow cell. Umożliwia analizę jednej lub dwóch flow cell jednocześnie i wybór pomiędzy czterema rodzajami flow cell.

Seria NovaSeq jest kompatybilna z szerokim wachlarzem zestawów do przygotowania bibliotek Illumina, od sekwencjonowania transkryptów do sekwencjonowania całych genomów. Dzięki zwiększonej przepustowości i obniżonej cenie na próbkę, seria NovaSeq jest idealna do zastosowań wymagających analizy dużej ilości danych. Seria NovaSeq łączy cechy, które sprawiają, że sekwenatory stacjonarne są łatwe w obsłudze, zapewnia w pełni zautomatyzowane generowanie klastrów. Zintegrowane, gotowe do użycia wkłady odczynników usprawniają konfigurację i zapobiegają niewłaściwemu ładowaniu. Materiały eksploatacyjne kodowane przez RFID umożliwiają w pełni zautomatyzowaną identyfikację odczynników. W sumie potrzeba zaledwie kilku minut na uruchomienie systemu NovaSeq 6000, co zwiększa wydajność laboratorium.

Wydajność wg. zastosowanej Flow Cell

NovaSeq 6000 System
Typ Flow Cell SP * S1 S2 S4
2 x 50 pz 65–80 Gb 134-167 Gb 333-417 Gb ND **
2 x 100 pz ND ** 266-333 Gb 667-833 Gb 1600-2000 Gb
2 x 150 pz 200-250 Gb 400-500 Gb 1000-1250 Gb 2400-3000 Gb
2 x 250 pz 325-400 Gb ND ** ND ** ND**
* Podane wartości zostały określone dla biblioteki kontrolnej Illumina PhiX przy rekomendowanych gęstościach klastrów.
** ND –  nie dotyczy

Liczba przefiltrowanych odczytów wg. zastosowanej Flow Cell

NovaSeq 6000 System
Typ Flow Cell SP * S1 S2 S4
Odczyty pojedyncze 600-800 milionów 1,3-1,6 miliarda 3,3-4,1 miliardów 8-10 miliardów
Odczyty sparowanych końców 1,3-1,6 miliarda 2,6-3,2 miliardy 6,6-8,2  miliardów 16-20 miliardów

Jakość odczytów * i czas reakcji **

NovaSeq 6000 System
Typ Flow Cell SP * S1 S2 S4
Jakość odczytów
2 x 50 pz ≥ 85% par zasad powyżej Q30 przy 2 × 50 pz
2 x 100 pz ≥ 80% par zasad powyżej Q30 przy 2 × 100 pz
2 x 150 pz ≥ 75% par zasad powyżej Q30 przy 2 × 150 pz
2 x 250 pz ≥ 75% par zasad powyżej Q30 przy 2 × 250 pz
Czas reakcji
2 x 50 pz ~13 godz. ~13 godz. ~16 godz. ND
2 x 100 pz ND ~19 godz. ~25 godz. ~36 godz.
2 x 150 pz ~25 godz. ~25 godz. ~36 godz. ~44 godz.
2 x 250 pz ~38 godz. ND ND ND
* Wskaźnik jakości Q-score określa prawdopodobieństwo wystąpienia błędu podczas identyfikacji nukleotydów. Procent par zasad > Q30 został uśredniony z całego odczytu. Przedstawione wartości Q-score zostały określone dla biblioteki kontrolnej Illumina PhiX z wykorzystaniem odczynników NovaSeq Reagent Kits i sekwenatora NovaSeq 6000. Dobór parametrów może się różnić w zależności od typu i jakości biblioteki, rozmiaru insertu, stężenia próbek i innych czynników
** Czas trwania reakcji obejmuje generację klastrów, sekwencjonowanie oraz identyfikację nukleotydów. Czas reakcji określono dla odczytów 2 flow cells tego samego typu; pomiar dwóch różnych flow cells zmienia czas reakcji.

Szacowana wydajność dla kluczowych aplikacji *

NovaSeq 6000 System
Typ Flow Cell SP * S1 S2 S4
Ludzkie genomy/reakcja ~4 ~8 ~20 ~48
Exomy/reakcja ~40 ~80 ~200 ~500
Transkryptomy/reakcja ~32 ~64 ~164 ~400
* Podane wartości są szacunkowe i zostały określone na podstawie podwójnego odczytu flow cell. Ludzkie genomy przyjmują >120 Gz danych w próbce, aby osiągnąć 30× pokrycie genomu. Exomy ok. 8 Gz/100×. Transkryptomy zakładają ≥50 mln odczytów. Wydajność może się różnić w zależności od użytego zestawu do przygotowania biblioteki.

Materiały

Powiązane produkty