System NovaSeq – nowa era w sekwencjonowaniu następnej generacji
System do sekwencjonowania NovaSeq firmy Illumina to urządzenie do sekwencjonowania w szerokim zakresie zastosowań. System NovaSeq 6000 zapewnia aplikacje z jeszcze wyższą wydajnością przy najniższych kosztach na próbkę. Seria NovaSeq zapewnia olbrzymią skalowalność i elastyczność, aby dostosować się do różnorodnych zastosowań i rozmiarów projektów przy jednoczesnym osiągnięciu maksymalnej wydajności. System wykorzystuje technologię sekwencjonowania przez syntezę (sequencing by synthesis – SBS) oraz technologię uporządkowanego wzoru flow cell. Umożliwia analizę jednej lub dwóch flow cell jednocześnie i wybór pomiędzy czterema rodzajami flow cell.
Seria NovaSeq jest kompatybilna z szerokim wachlarzem zestawów do przygotowania bibliotek Illumina, od sekwencjonowania transkryptów do sekwencjonowania całych genomów. Dzięki zwiększonej przepustowości i obniżonej cenie na próbkę, seria NovaSeq jest idealna do zastosowań wymagających analizy dużej ilości danych. Seria NovaSeq łączy cechy, które sprawiają, że sekwenatory stacjonarne są łatwe w obsłudze, zapewnia w pełni zautomatyzowane generowanie klastrów. Zintegrowane, gotowe do użycia wkłady odczynników usprawniają konfigurację i zapobiegają niewłaściwemu ładowaniu. Materiały eksploatacyjne kodowane przez RFID umożliwiają w pełni zautomatyzowaną identyfikację odczynników. W sumie potrzeba zaledwie kilku minut na uruchomienie systemu NovaSeq 6000, co zwiększa wydajność laboratorium.
NovaSeq 6000 System | |||||
---|---|---|---|---|---|
Typ Flow Cell | SP * | S1 | S2 | S4 | |
2 x 50 pz | 65–80 Gb | 134-167 Gb | 333-417 Gb | ND ** | |
2 x 100 pz | ND ** | 266-333 Gb | 667-833 Gb | 1600-2000 Gb | |
2 x 150 pz | 200-250 Gb | 400-500 Gb | 1000-1250 Gb | 2400-3000 Gb | |
2 x 250 pz | 325-400 Gb | ND ** | ND ** | ND** | |
* Podane wartości zostały określone dla biblioteki kontrolnej Illumina PhiX przy rekomendowanych gęstościach klastrów. ** ND – nie dotyczy |
NovaSeq 6000 System | |||||
---|---|---|---|---|---|
Typ Flow Cell | SP * | S1 | S2 | S4 | |
Odczyty pojedyncze | 600-800 milionów | 1,3-1,6 miliarda | 3,3-4,1 miliardów | 8-10 miliardów | |
Odczyty sparowanych końców | 1,3-1,6 miliarda | 2,6-3,2 miliardy | 6,6-8,2 miliardów | 16-20 miliardów |
NovaSeq 6000 System | |||||
---|---|---|---|---|---|
Typ Flow Cell | SP * | S1 | S2 | S4 | |
Jakość odczytów | |||||
2 x 50 pz | ≥ 85% par zasad powyżej Q30 przy 2 × 50 pz | ||||
2 x 100 pz | ≥ 80% par zasad powyżej Q30 przy 2 × 100 pz | ||||
2 x 150 pz | ≥ 75% par zasad powyżej Q30 przy 2 × 150 pz | ||||
2 x 250 pz | ≥ 75% par zasad powyżej Q30 przy 2 × 250 pz | ||||
Czas reakcji | |||||
2 x 50 pz | ~13 godz. | ~13 godz. | ~16 godz. | ND | |
2 x 100 pz | ND | ~19 godz. | ~25 godz. | ~36 godz. | |
2 x 150 pz | ~25 godz. | ~25 godz. | ~36 godz. | ~44 godz. | |
2 x 250 pz | ~38 godz. | ND | ND | ND | |
* Wskaźnik jakości Q-score określa prawdopodobieństwo wystąpienia błędu podczas identyfikacji nukleotydów. Procent par zasad > Q30 został uśredniony z całego odczytu. Przedstawione wartości Q-score zostały określone dla biblioteki kontrolnej Illumina PhiX z wykorzystaniem odczynników NovaSeq Reagent Kits i sekwenatora NovaSeq 6000. Dobór parametrów może się różnić w zależności od typu i jakości biblioteki, rozmiaru insertu, stężenia próbek i innych czynników ** Czas trwania reakcji obejmuje generację klastrów, sekwencjonowanie oraz identyfikację nukleotydów. Czas reakcji określono dla odczytów 2 flow cells tego samego typu; pomiar dwóch różnych flow cells zmienia czas reakcji. |
NovaSeq 6000 System | |||||
---|---|---|---|---|---|
Typ Flow Cell | SP * | S1 | S2 | S4 | |
Ludzkie genomy/reakcja | ~4 | ~8 | ~20 | ~48 | |
Exomy/reakcja | ~40 | ~80 | ~200 | ~500 | |
Transkryptomy/reakcja | ~32 | ~64 | ~164 | ~400 | |
* Podane wartości są szacunkowe i zostały określone na podstawie podwójnego odczytu flow cell. Ludzkie genomy przyjmują >120 Gz danych w próbce, aby osiągnąć 30× pokrycie genomu. Exomy ok. 8 Gz/100×. Transkryptomy zakładają ≥50 mln odczytów. Wydajność może się różnić w zależności od użytego zestawu do przygotowania biblioteki. |
Necessary cookies are absolutely essential for the website to function properly. This category only includes cookies that ensures basic functionalities and security features of the website. These cookies do not store any personal information.
Any cookies that may not be particularly necessary for the website to function and is used specifically to collect user personal data via analytics, ads, other embedded contents are termed as non-necessary cookies. It is mandatory to procure user consent prior to running these cookies on your website.