MiniSeq to prosty w obsłudze, niewielkich rozmiarów sekwenator NGS, który wyposażony jest w intuicyjne oprogramowanie służące do kontrolowania parametrów reakcji oraz do analizy uzyskanych wyników.
MiniSeq to prosty w obsłudze, niewielkich rozmiarów sekwenator NGS, który wyposażony jest w intuicyjne oprogramowanie służące do kontrolowania parametrów reakcji oraz do analizy uzyskanych wyników. Urządzenie MiniSeq pozwala na sekwencjonowanie małych genomów i samodzielnie przygotowanych bibliotek amplikonowych, a także na wykonanie celowanego sekwencjonowania DNA i RNA (w oparciu o gotowe, zdefiniowane panele NGS lub z wykorzystaniem projektowanych samodzielnie paneli DNA lub RNA) z użyciem niewielkich ilości wyjściowego materiału genetycznego.
Zasada działania MiniSeq opiera się o znaną i sprawdzoną technologię sekwencjonowania przez syntezę (SBS), która zapewnia uzyskanie wysokiej jakości danych dla bibliotek NGS różnego rodzaju. Użytkownik ma możliwość decydowania o skali przepustowości sekwenatora. Zależnie od wymagań bieżących projektów może sięgnąć po odczynniki do sekwencjonowania dedykowane do MiniSeq w jednym z dwóch trybów pracy: High Output lub Mid Output.
MiniSeq System High-Output Kit* | MiniSeq System Mid-Output Kit* | |||||
---|---|---|---|---|---|---|
Zakres długości odczytu | 2 × 150 pz | 2 × 75 pz | 1 × 75 pz | 2 × 150 pz | ||
Czas trwania reakcji | ~24 godz. | 13 godz. | 7 godz. | 17 godz. | ||
Wydajność | 6,6–7,5 Gb | 3,3–3,75 Gb | 1,65–1,875 Gb | 2,1–2,4 Gb | ||
* Podane wartości zostały określone dla biblioteki kontrolnej Illumina PhiX przy rekomendowanych gęstościach klastrów (129 – 165 k/mm2 klastrów przechodzących przez filtr). Właściwy dobór parametrów może się różnić w zależności od rodzaju i jakości próbki oraz klastrów przechodzących przez filtr. Wszystkie zestawy MiniSeq są kompatybilne do pracy w trybie sparowanych końców (ang. paired-end). |
MiniSeq System High-Output Kit | MiniSeq System Mid-Output Kit | |
---|---|---|
Odczyty pojedyncze |
22–25 milionów | 7–8 milionów |
Odczyty sparowanych końców |
44–50 milionów | 14–16 milionów |
MiniSeq System High-Output Kit | MiniSeq System Mid-Output Kit |
---|---|
> 80% par zasad powyżej Q30 przy 2 × 150 pz | > 80% par zasad powyżej Q30 przy 2 × 150 pz |
> 85% par zasad powyżej Q30 przy 2 × 75 pz | |
> 85% par zasad powyżej Q30 przy 1 × 75 pz | |
* Wskaźnik jakości Q-score określa prawdopodobieństwo wystąpienia błędu podczas identyfikacji nukleotydów. Procent par zasad > Q30 został uśredniony z całego odczytu. |
Necessary cookies are absolutely essential for the website to function properly. This category only includes cookies that ensures basic functionalities and security features of the website. These cookies do not store any personal information.
Any cookies that may not be particularly necessary for the website to function and is used specifically to collect user personal data via analytics, ads, other embedded contents are termed as non-necessary cookies. It is mandatory to procure user consent prior to running these cookies on your website.