Sekwenator NGS MiniSeq

Opis

MiniSeq to prosty w obsłudze, niewielkich rozmiarów sekwenator NGS, który wyposażony jest w intuicyjne oprogramowanie służące do kontrolowania parametrów reakcji oraz do analizy uzyskanych wyników. Urządzenie MiniSeq pozwala na sekwencjonowanie małych genomów i samodzielnie przygotowanych bibliotek amplikonowych, a także na wykonanie celowanego sekwencjonowania DNA i RNA (w oparciu o gotowe, zdefiniowane panele NGS lub z wykorzystaniem projektowanych samodzielnie paneli DNA lub RNA) z użyciem niewielkich ilości wyjściowego materiału genetycznego.

Zasada działania MiniSeq opiera się o znaną i sprawdzoną technologię sekwencjonowania przez syntezę (SBS), która zapewnia uzyskanie wysokiej jakości danych dla bibliotek NGS różnego rodzaju. Użytkownik ma możliwość decydowania o skali przepustowości sekwenatora. Zależnie od wymagań bieżących projektów może sięgnąć po odczynniki do sekwencjonowania dedykowane do MiniSeq w jednym z dwóch trybów pracy: High Output lub Mid Output.

Przybliżony czas reakcji i wydajność (generowanie klastrów i sekwencjonowanie)

	MiniSeq System High-Output Kit*			MiniSeq System Mid-Output Kit*
Zakres długości odczytu	2 × 150 pz	2 × 75 pz	1 × 75 pz	2 × 150 pz
Czas trwania reakcji	~24 godz.	13 godz.	7 godz.	17 godz.
Wydajność	6,6–7,5 Gb	3,3–3,75 Gb	1,65–1,875 Gb	2,1–2,4 Gb
* Podane wartości zostały określone dla biblioteki kontrolnej Illumina PhiX przy rekomendowanych gęstościach klastrów (129 – 165 k/mm2 klastrów przechodzących przez filtr). Właściwy dobór parametrów może się różnić w zależności od rodzaju i jakości próbki oraz klastrów przechodzących przez filtr. Wszystkie zestawy MiniSeq są kompatybilne do pracy w trybie sparowanych końców (ang. paired-end).

Liczba przefiltrowanych odczytów

	MiniSeq System High-Output Kit	MiniSeq System Mid-Output Kit
Odczyty pojedyncze	22–25 milionów	7–8 milionów
Odczyty sparowanych końców	44–50 milionów	14–16 milionów

Jakość odczytów *

MiniSeq System High-Output Kit	MiniSeq System Mid-Output Kit
> 80% par zasad powyżej Q30 przy 2 × 150 pz	> 80% par zasad powyżej Q30 przy 2 × 150 pz
> 85% par zasad powyżej Q30 przy 2 × 75 pz
> 85% par zasad powyżej Q30 przy 1 × 75 pz
* Wskaźnik jakości Q-score określa prawdopodobieństwo wystąpienia błędu podczas identyfikacji nukleotydów. Procent par zasad > Q30 został uśredniony z całego odczytu.